Возьмите голую систему (например любую виртуальную машину) и установите на неё, если центр обновления будет работать, то продолжайте ставить весь софт, который используется на пользовательских компах. Если ошибка не выскочит, значит когда-либо в своё время все компы, на которых произошла ошибка получили какую-либо общую настройку, которая и привела к сбоям.
Соответственно если на госте центр обновления сразу перестал работать, то звонок в ТП СЗИ с вопросом:
"Чуваки, установил ваш софт, всё слетело, установил на голую систему, всё слетело, ничего не работает, с кем поговорить по этому поводу?")