Эм... любая программа запускается в окружении операционной системы. Программа не сможет работать, если операционная система неожиданно перестанет работать. Можно найти утилиты которые наплевав на элементарные проверки, начнут форматировать диск, но все закончится тем, что будет испорчена файловая система, без очистки диска как такового.
Через биос ничего не форматируется, он не для этого создан. Вам необходима любой загрузочный диск (флешка), которая содержит в себе соответствующую утилиту. Хоть установщик ОСи, хоть реаниматор и т.д.
