Тут 2 варианты.
1. Они на самом деле не дураки. Или так - не они на самом деле дураки.
Без обид но в данном случае "дураком"=не правым можете быть и вы.
Просто мы так устроены что за собой не замечаем - кто же усомнится в собственной правоте.
2. Они на самом деле "дураки". В кавычках потому что у них тоже может быть начальник и ваш начальник считает что его не прав, но он вынужден проводить его мнения подчиненным и вам он прямо об этом не скажет, т.к. субординация.

Спорить - однозначно нет.
В лучшем случае он вежливо выслушает и скажет - "делай как я сказал".
Главное иметь доказательство (письмо, распоряжение) что вы делаете ровно то что сказал начальник. Чтобы в случае чего он потом не переобулся - "ты меня неправильно понял"

Что касается работать ли под руководством таких людей - тут много аспектов например псих. комфорт, недавно устроились и чтобы не выглядеть летуном, мат.блага (зп), перспективы и т.д.

Желание думать - так думайте параллельно "в стол" "про себя".
"Все решает начальство" - это 99,9999%. Это норма.