Tre One

а чем посторонние исходники отличаются от изменений, сделанных вручную?

- делаем новый бранч своего репо
- удаляем из этого бранча всё
- копируем сторонние исходники
- коммитим
- мержим в мастер

в итоге посторонние изменения вкатываются в свои