Как уже посоветовали, gulp-uncss должен помочь. В хроме в инструментах разработчика на вкладке "Audit" запустите собственно аудит и в результатах среди прочего будет список неиспользуемых селекторов на странице и процент от всего css.
сделайте форк проекта cms, вносите туда свои правки и периодически мерджитесь с мастером.
Если же изменения полезны - выносите в ишусы для обсуждения и предлагайте пул реквесты.
