Teermit

Через _popen так нельзя, насколько я знаю
Под POSIX решением было бы использовать pipe() и fork(), но под Windows это, скорее всего, не будет работать
Если вывод команд не важен, можно использовать system("..."), но это не всегда будет работать
Более правильный вариант: запускать CMD через WinAPI посредством CreateProcess, пример есть тут: https://msdn.microsoft.com/ru-ru/library/windows/d...
P.S. C++, вероятно, далеко не самое лучшее решение для этой задачи

Правильное решение: использовать решения вроде Elastic.
Однако для этого Elastic надо куда-то поставить, что не всегда допустимо.
Любые другие решения будут костылём различной степени кривости.
Вариант с написанием обвязки будет катастрофически медленным, и, более того, не нужным, потому что всё можно сделать средствами СУБД
Костыльное решение, работающее на голой СУБД:

• Для каждого ряда в БД используя самопальную версию поиска подстроки, допускающую ошибки, найти вхождения каждого поля в строку, по которой ведётся поиск.
  
• Построить оценку каждого ряда, основанную на сумме длин найденных подстрок и количестве ошибок (этот пункт требует экспериментов на реальных данных).
  
• Отсортировать результат по этой оценке