А с каких пор iframe и его содержимое стали некликабельными? Он для этого и был создан. Попробуйте добавить где-нибудь у себя iframe со ссылками, картинками и пр. — сразу всё поймёте.
1. Сделайте выделение на слое с фигурой.
2. Смените слой с фигурой на нужный кликом, не снимая выделения.
3. Удаляйте ненужное с помощью выделения.
4. PROFIT???