<input class="one value">, <input class="two value">, <input class="result">
При нажатии на кнопку просто клонируйте строку и больше не делайте ничего. Создайте еще один обработчик события изменения (onChange, onBlur или что там вам больше подходит) любого инпута с классом .value, который будет определять в какой строке произошел клик (при помощи $(this).closest('tr')), затем будет выполнять поиск всех инпутов (.one, .two, .result) в строке, рассчитывать сумму (или что там у вас) и записывать результат в нужную ячейку. Все — profit.
Неважно что было в колбэке до присвоения, после присвоения в нем будет прототип всех функций. При этом колбэк не имеет никакой возможности повлиять на прототип.