Sergey78

Поднимаете на своем сервере DNS-сервер, для убунты это например BIND. Статей по настройке куча. Сервер настраиваете как master-сервер для зоны .dom, и как forward на dns провайдера для всех остальных.
На DHCP сервере всем клиентам раздаете адрес своего DNS сервера.
С настройкой virtual domain на апаче думаю справитесь.

Но вообще, идея с зоной .dom может быть не совсем верной с точки зрения стандартов. Работать безусловно будет, но лучше использовать зону dom.local

Сообщение про «can`t initialize iptables table 'filter'» только при первой попытке добавления правила?
На загруженной системе из консоли вы можете добавить правило?
Каким образом стартуют у вас правила при запуске, через if-up скрипт?

На всякий случай, на будущее.
Grub умеет грузиться с флешки из .iso образа. Т.е. в загрузчик флэшки grub, на флэшку .iso и вперед. Для винды есть пакет grub4dos и Gui-морда к нему. Примеры habrahabr.ru/post/99159/

Сам спросил, сам нашел.
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power idle-dim-ac false
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power idle-dim-battery false