Если в компьютере только SSD, то убедитесь, что на них достаточно свободного места. Некоторые модели при заполнении более 70-80% жутко тормозят.
Если есть HDD, то проверьте их HDAT3, загрузив компьютер с флешки. Возможно, что есть сбойные секторы и HDD подвешивает систему при обращении к ним.