Правильный алгоритм
- забэкапить всех данные;
- заменить сбойный HDD, зайти в настройки raid'а, сделать его hotspare для данного массива, дождаться окончания ребилда.
- если хочется, то аналогично заменить второй HDD;
- если "всё пропало, шеф", то восстановиться с бэкапа.