Знание PHP, CSS. JS лишним не будет, но можно обойтись и без него, если подобрать изначально подходящий по дизайну параметров шаблон, который не придется "допиливать" через файлы.
Такого не должно быть: для вывода категорий используется один шаблон, для вывода полных материалов - другой. Возможно кто-то перемудрил с файлами шаблонов. Для проверки можно сменить шаблон на стандартный Protostar: если всё будет отображаться корректно, то проблема в файлах для проблемного шаблона.
Если вы хотите вставлять цену в тег title автоматически, то без хаков в файлах это сделать не получится. Однако можно это делать ручками в текстовом поле META title для каждого товара в отдельности:
Через jce не получится. Такой функционал можно реализовать через платную версию плагина Modals от разработчика популярных для Joomla расширений RegularLabs.
Dj-classifieds — компонент Joomla для создания досок объявлений.
SP Page Builder — конструктор страниц (лендингов).
Это разные расширения, которые можно использовать на одном сайте, но отдельно друг от друга.
Akeeba Backup — лучшее расширения для резервного копирования сайтов на CMS Joomla. Даже в бесплатной версии вы можете настроить создание автоматических бэкапов, а с помощью платной можно обеспечить автоматическую отпарвку резервных копий в облачные сервисы (например DropBox). Подробный материал об Akeeba Backup с виедо-уроками смотрите здесь.
Не рекомендую вставлять номер телефона в качестве пункта меню. Это некорректно с точки зрения SEO. Лучше вставить его в качестве модуля в позицию меню и отладить отображение CSS-стилями.
Скорее всего дело в каком то стороннем SEO-плагине. Внимательно просмотрите список плагинов в Расширения → Плагины. Обратите внимание на наличие слова SEO или SEF (но его может и не быть) в названии плагина.