Radjah

Зачем тебе БД в каталоге юзера? Правами на базу должен рулить сервер БД.

Пропиши маршрут до нужного адреса через нужный интерфейс.
ip route в помощь. Ман.

Собираешь с помощью кросскомпилятора ядро по конфигу для процессора приставки, собираешь всё окружение и оболочку, упаковываешь собранное в образ, чтобы он помещался на флешку приставки
Прошиваешь и включаешь.

Тут какая-то каша. Сделай все пути к бинарникам полными.

> wget -q -O -
Зачем гадить результатом в логи крона?

> /var/www/dir_name/clear_logs.php
Интерпретатор не указан

> /usr/bin/php5.6 -O - -q -t 1

У php нет опции "-O".

-t docroot     Specify the document root to be used by the built-in web server

Можно попробовать с помощью ddrescue сделать raw-образ и насиловать уже его.

> решил начать изучение linux
Для этого есть Debian, Ubuntu, Fedora с кучей документации к ним.

Чего на этот kali так тянет? Для других целей его делали.

> Хочу на райде примонтировать как /home, подкажите как сделать?
Забить автоподнятие массива в /etc/mdadm/mdadm.conf (mdadm --detail --scan /dev/md/0)
Отформатировать и прописать в /etc/fstab. Лучше по UUID (blkid)

Модули разные бывают. Смотри выхлоп dmesg при подключении. Скорее всего не стоит пакет firmware с нужной прошивкой для модуля.

> Чтоб при подключении к другому компьютеру, она использовала его сеть для доступа к внешним ресурсам.
Либо мост, либо настроить форвардинг трафика, либо NAT. Всё на машине, в которую вставляется Pi.

iptables -t nat -A POSTROUTING -s 10.128.0.0/24 -j MASQUERADE

или

iptables -t nat -A POSTROUTING -i usb0 -o eth0 -j MASQUERADE

10.128.0.0/24 - адрес Pi или сеть, в которой находится Pi. Можно назначить статически что-нибудь.
usb0 - интерфейс, на котором висит Pi.
eth0 - интерфейс, который смотрит в нужную сеть.

Я бы всё же купил WiFi-адаптер на realtek, например, и кусок витой пары, чтобы такими костылями не заниматься.

Можно в /sys посмотреть, там обычно всё торчит.

В винде MPC-HC для видео и foobar2000 для музыки.

В линуксах mpv с мордами для видео и MPD для музыки.

/var/log/journal в бинарном виде. Для чтения используется journalctl. В логи пишется весь выхлоп из stdout и stderr.

Если хочется прям текста, то можешь указать директиву StandardOutput, но параметр file:path работает только с 236-й версии. Можешь написать syslog и разрулить запись логов уже им.

/boot/efi на 128 МБ, если загрузка через UEFI, а не CSM.
swap на RAM+1ГБ, если будет нужно засыпание на диск вместо выключения. Без этого зависит от объема оперативной памяти. В любом случае 1-2 гига за глаза. Выключаторов swap не слушай, они не в себе.
Остальное под /, потому что программы будут ставиться, файлы "временно" в /home скидываться, а где-нибудь место рано или поздно закончится.

convert file.svg -write file.pdf

Только librsvg2-bin и imagemagick надо поставить

> Пытаюсь обновить
Не вижу в команде ключ renew

Тормозной способ.
Поставить ntfs-3g и монтировать им через fuse.

Скоростной способ.
Скачать бесплатный вариант Microsoft NTFS for Linux by Paragon Software и монтировать с типом ФС ufsd.

Первый вариант даже на USB3 выдавал не более 20-25МБ/сек, второй вариант дотягивал до 100-110МБ/сек.

Главный недостаток второго варианта - нет поддержки DKMS (вручную переставлять при каждом изменении версии ядра) и утилит для проверки целостности ФС. (Есть в платном варианте.)