Решение:
1. Получаем рут.
2. Запускаем adb.exe из Android SDK для windows, (включаем отладку по USB)
3. пишем в консоли:
su
dd id=/dev/block/mmcblk0 of=/Removable/MicroSD/bacup.iso
(SD карта может монтироваться в другое место)
А дальше образ диска распознается как обычный Ext4 (например на PC3000)