PaulJE

Начав с азов и собрав на коленке свой сайт, тебе придется преодолеть такие проблемы, которые обычно разработчику очень редко выпадает "разбирать". Зато в будущем конечно очень облегчит понимания всей системы в целом. Можно годами работать, писать на cms/фреймверках, и не знать как работает HTTP, в чем разница GET или POST, что такое sql иньекция и пр.
Обратная сторона в том, что фреймверк сразу прививает "культуру", у него есть структура, есть готовые компоненты, гораздо проще реализовать многие вещи чем изобретать свои велосипеды. Я бы предложил пройтись по всем основам, и начать конечно с фреймверка, Laravel отличный выбор для новичка, можно даже что-то проще типа slim или silex, там тебе придется больше писать "своего" кода. Ну а после энного количества месяцев, когда ты почувствуешь что "все" знаешь, просто попробуй взять и написать что-нибудь на "symfony")

Собственно тебе нужен сделать внедрение через DI, сам провайдер ведь описан у тебя в сервисах? Ну так и инжектируй в него менеджер сущностей.
Получиться нечто такое:

private $_em;
public function setEntityManager(EntityManager $em) {
    $this->_em = $em;
}

public function authenticate(TokenInterface $token)
{
    // Тут вышеописанная рутина
    $this->_em->persist($user);
    $this->_em->flush();

$(window).unbind('.PLUGIN_NAME');
$(document).unbind('.PLUGIN_NAME');
$this.removeData('PLUGIN_NAME');

Смотря что подразумевается по скрещиваением. Symfony весьма гибкий продукт, и есть возможность вытягивать из него отдельные компоненты для внедрения в свое приложение. Но я как понимаю вам нужно решение для администрирования сущностей, аля CRUD для всего и вся? На базе Symfony можно использовать автогенерирование моделей по схеме из БД и прикрутить какой нибудь SonataAdminBundle

Еще серверную часть называют - backend, клиентскую - frontend.

Получается бакэнд - "обратная сторона" которая не видна юзеру, фронтенд - "повернутая лицом юзеру" - клиентская

$usernames = array('first', 'second');

if (! in_array($logger, $usernames)) {
    header("location: /");
    exit();
}