man iostat avgrq-sz The average size (in sectors) of the requests that were issued to the device. avgqu-sz The average queue length of the requests that were issued to the device.
Среднюю очередь за какой период времени? Снимать данные из нужного места с необходимой периодичностью, писать куда-то и потом считать среднее значение простой арифметикой за нужный период времени.
