Ваш выход это Docker.
На малинку ставите ОС, на эту ОС докер и создаёте контейнер (грубо говоря виртуальную машину) с нужной вам ОС. Основную ОС ни при каких условиях больше не трогаете, а с той что крутится в контейнере можете делать всё что угодно, а когда решите переставить, то старый контейнер удаляете, и из образа поднимаете новый контейнер и всё.
Сложного тут ничего нет. Документация у докера хорошая, на ютубе роликов про него куча.