Вместо phpmyadmin рекомендую использовать использовать adminer. Альтернатива более легковесная, но от этого не менее функциональная, есть поддержка других СУБД.
Советую посмотреть на решения, которые можно использоваться с любым php фреймворком. Иначе в случае переезда вам будет нужно искать что-то новое, адаптированное под конкретный фреймворк. Первое, что приходит на ум это Doctrine Database Migrations. Вот вариант использования независимый от фреймворка ссылка. А это в связке с Zend 2 ссылка
Есть рекомендации по написанию PHP кода, которые желательно соблюдать. Вот вам даже на русском языке - PSR-2
И постарайтесь не использовать var, а явно указывайте модификатор доступа к свойству.