1. Можете делать как Вам удобнее. Ходят мифы что гугл любит поддомены, а яндекс папки - ложь. Везде есть свои плюсы и минусы.
2. При подобном продвижении учтите уникальность страниц и сразу проработайте вероятность низкокачественных страниц и дублей. Поменять только названия города - такого метода недостаточно.