Прохожу java 101 на hexlet.io, в целом, могу советовать

1. Боб Мартин "Чистый код";
2. Мартин Фаулер "Рефакторинг. Улучшение существующего кода".
На обе книги есть множество положительных рецензий и обзорных статей, на том же хабре.