Maradondt

чекбоксы вообще не стилизуются
они скрываются через дисплей none
а из label делается кастомный переключатель
В зависимости от состояния чекбокса. к нему применяются стили с помощью такой конструкции
[type="checkbox"]:checked + label
И клик на label в свою меняет состояние чекбокса.

Как это работает есть в примере

Интересно, какой ответ Вы ожидаете? Скажу так: жить ему аж до самого его конца.
Опасения Ваши обоснованны в плане того, что вакансии php программиста (в моем регионе) встречаются все реже.
А избежать или смягчить последствия смены технологии можно, если не зацикливаться только на php, а изучать и другие языки и технологии и стараться использовать "best practices". Это мое мнение, могу и ошибаться.