Да конечно же можете и не только два но и больше. На всякий случай только что проделал git clone с гитхаба и все в колабе работает. Последовательность действий была следующая.
1. Создал пустой notebook дал ему доступ к drive
from google.colab import drive
drive.mount('/content/drive')
2.
%cd drive/My\ Drive/
%mkdir repos
%cd repos
3.
!git clone репозитарий (без ковычек просто адресс)
4. Все дальше вернулся в drive, нашел новый репозитприй и запустил с него несколько нотебуков (они открылись каждый в новой вкладке) и запустил код естественно в этих нотебуках. Работает без каких либо проблем.