Аналогичная проблема - после нажатия "Пуск" начинаю искать что-либо на компьютере и если нажимаю Pause (punto switcher), то русский язык сразу отваливается.
Пока лечусь только перезагрузкой.
PS стоит punto switcher 3.2.9 с отключенным автопереключением и включено запоминание выбранного языка ввода для приложений.