Вопрос по-прежнему открыт, переносить базу обратно на sql - проблема, жалко лицензии, начальство не одобрит. Может есть еще какие-то варианты?
Upd. Обновление конфигурации немного ускорило процесс, но по-прежнему долго формирует прайс-лист для обновления цен