Установщик Ubuntu содержит продвинутые средства разметки. На этапе "Тип установки"* нужно выбрать пункт "Другой вариант"*, это позволит удалить и создать нужные разделы. Можно загрузить Ubuntu не сразу в режим установки, а в режим ознакомления, чтобы посмотреть какой из разделов какой (где данные, а где система, сопоставить их можно по номерам, по меткам, по размеру, свободному месту), т.е. обезопасить себя от удаления нужного раздела.
* - 16.04 я не ставил, названия пунктов могут отличаться.
