pyinstaller --onefile --windowed \
--add-data "resources/*:resources" \
--add-data "lab1/*:lab1" \
--add-data "lab2/*:lab2" \
--add-data "lab3/*:lab3" \
--add-data "login/*:login" \
--add-data "main_menu/*:main_menu" \
--paths "/" \
main.py
./main
. Просто эту команду, без всяких wine, понимаете?