Этот файл содержит пути, по которым производится поиск библиотек. Т. е. вместо того, чтобы пытаться исправить место установки, можно просто объявить ещё одно место, в котором эти библиотеки будут искаться при запуске программ.
ld — dynamic linker, часть gcc и исторически линкеров unix.
ldconfig обновляет кэш имён библиотек и их версий.