Вариантов много. Пожертвования, платность для коммерческого использования, платность для компаний, платность для желающих (тоже самое что и пожертвования практически: желающие могут купить программу чтобы поддержать разработчика, остальные качают за так; по такой схеме работает Sublime Text 2), «платное исправление багов» (как в Ubuntu).