Еще один момент, который может существенно повлиять на принятие окончательного решения, это размер и внешний вид системы. Тот же бокс от Synology весьма компактен и (на мой вкус) выглядит чуть более эстетично, чем обычный системный блок, его можно поставить на полку и он будет почти не заметен. Как правильно сказал track, чтобы добиться того же самого функционала,
что и Synology придется основательно потрудиться.
Если решение будет принято в сторону самостоятельного проекта, то имеет смысл взять маленькую материнскую плату с пассивным охлаждением — вот
ASUS или
Tyan (наверняка, есть и другие) Чем меньше вентиляторов, тем дома тише.