Как удалить программу в Линуксе?

подозреваю, вы не установили программу, а скачали то, из чего собирается программа.
Тогда надо удалить эту папку.

Как удалить программу в Линуксе?

zebralaska,
sudo apt-get remove beeloger

если программа была установлена с помощью средств операционной системы, то по записям в системе управления пакетами (программами) удалятся связанные с программой файлы и папки.