$data = file_get_contents('php://input'); // весь ввод перенаправляем в $data
// Здесь я выводил
$data = json_decode($data, true); // декодируем json-закодированные-текстовые данные в PHP-массив
Header находится в файле под номером 1. Его нужно встроить в файл, которы находится в папке в 2. Ваш код работает только в файле index.php, который соответственно находится не в папке.
{"update_id":498556965,
"message":{"message_id":234,"from":{"id":":"*******",","is_bot":false,"first_name":"\u0422\u0430\u0440\u0430\u0441","last_name":"\u0418\u0432\u0430\u043d\u043e\u0432","username":"":"*******","","language_code":"ru"},"chat":{"id":":"*******",","first_name":"\u0422\u0430\u0440\u0430\u0441","last_name":"\u0418\u0432\u0430\u043d\u043e\u0432","username":"*******","type":"private"},"date":1653411588,"text":"4"}}