Irismet

Судя по ошибкам из лога, вы скопировали данные под своей учеткой, а жира запускается под другой учеткой jira, и у нее нет прав удалять или изменять файлы в скопированной вами директории, нужно сменить владельца всех файлов и папок в установочном и домашнем каталогах жиры на пользователя - jira.

Через бэкап xml. В настройках системы в пункте резервное копирование создать бэкап. Развернуть пустую жиру с постгре базой и восстановить в ней бэкап

В настройках самого пространства нужно выполнить экспорт, а импорт уже выполнять в настройках системы целевого конфлюенса, выбирать импортировать раздел(в разных версиях кнопки могут называться по-разному)