Назовите каждый попап индивидуальным именем. Например с помощью id.
<div id="popup_1">...</div>
<div id="popup_2">...</div>
Сделайте на кнопках открытия ссылки на эти попапы, например с помощью data-атрибутов:
<button class="time-work" data-popup="popup_1">Open 1</button>
<button class="time-work" data-popup="popup_2">Open 2</button>
Немного модифицируйте обработчик кликов, чтобы открывать только нужный:
$('.time-work').on("click", function () {
var target = $(this).data("popup");
$("#" + target).show();
});
Это решение хорошо тем, что не нужна вложенность попапов в кнопки их открытия. Попапчики могут лежать совершенно в любом месте.