Вы точно хорошо подумали, прежде чем выбрать такую странную смесь архитектур?
p.s. правда я и сам бы мог так сделать, если бы потребовалось писать сложный интерфейс, а вычислительная логика уже была бы на python, так как в visual studio на .net писать сложные формочки удобнее всего (имхо).
Если вас не интересует полноценная поддержка обновлений а так же вас не волнует что архив установки будет толстым (особенно это замечают когда будете делать частые обновления), тупо складывайте заранее установленный каталог python в отдельный каталог и пользуйтесь (максимум перед запуском переменные окружения прописывайте), в этом случае за обновление будете отвечать сами. Но даже в этом случае хорошим жестом будет являться предложение установки приложения без питона, ожидая его уже установленным на машине пользователя. Почему вариант таскать питон с собой плохой? - поддержка, через три десять лет, чтобы запустить ваше приложение с поддержкой современного оборудования, понадобится
пуд соли и ершик для чистки унитаза (особенно это актуально для gpgpu/opencv подсистем).
Самое красивое решение - загружать и устанавливать все необходимое на машине пользователя, включая опцию - загрузить без установки, чтобы перенести каталог с этим кешем на машину без интернета.
Если у вас linux с нормальными пакетными менеджерами, пользуйтесь ими, и программными пакетами в их формате (apt/rpm/ebuild/..), и они сделают все необходимое за вас в лучшем виде! Если же windows...
В не кастрированных (не домашние) версиях windows10 можно попытаться запустить бинарники ubuntu/debian, если не требуется gui, это почти наверняка будет работать, т.е. вы можете использовать штатный пакетный менеджер apt, ив пару команд установить/обновить все все необходимое
Можете так же устанавливать python в тихом режиме, скачав установщик с сайта
https://www.python.org/downloads/, это будет занимать меньше места, но в случае если вам нужны необычные модули, то вам может не повезти найти собранные под windows, да и те что есть, обычно требуют ручную установку.. в общем не все там легко автоматизируется, пути загрузок внезапно могут через год другой исчезнуть и пользователи получат проблему.
Универсально, можете воспользоваться готовой linux подсистемой для windows - cygwin (на столько долгой и качественной поддержки почти всего из мира windows в linux вы не найдете), и таскайте в своем установщике их setup.exe (кстати он всегда доступен для загрузки с сайта по одному и тому же url) в режиме Unattended setup mode (--quiet-mode), вместе с питоном вы получите базовый набор утилит командной строки и кучу еще чего теоретически лишнего, но поверьте, оно не помешает, особенно если вам нужна автоматизация процессов управления установкой на машине клиента.
