Нет.
Разделение на разделы это просто абстракция для пользователя.
На работу жесткого диска она никак не влияет.
Однако в случае HDD такое разделение позволяет четко зафиксировать за логическим разделом физическое пространство магнитных пластин. И работа с первыми разделами будет несколько быстрее чем с последними.
Но это не всегда заметно и сильно зависит от ФС, типа нагрузки и множества других факторов.
В случае SSD это вообще условность.