winmerge.org и его вариации
https://sourceforge.net/p/winmerge/news/2018/01/a-...
Компаратор в Total Commander
https://www.grigsoft.com/art_totcmd.htm сравнивает и локальные файлы и локальные с файлами на удаленном сервере (через ssh)
Оба варианта позволяют править сравниваемые файлы.