Может я чего-то не понимаю, но как можно куски ВП, который написан на ПХП переписать на низкоуровневый язык? Как будут работать функции, темы и плагины? Как это все поженится?
Наполнить базу сотней тысяч товаров вы сможете, и сайт будет более-менее работать, если жестко все закешировать. Но придется сильно заморочиться с поиском товаров -- подключать эластик, сфинкс или еще что-то для пережевывания таких объемов.
Так что лучше посмотрите в сторону Опенкарта или Битрикса.
На вашем месте я бы полностью перешел на Nginx + php-fpm.
На nginx можно ограничить количество запросов в секунду к сайту с помощью этого модуля, также с помощью Nginx можно жестко закешировать страницы, и еще можно ограничить доступ с нежелательных ip-адресов (допустим из Африки, Китая и других ненужных стран).