Поэтому хотелось бы уточнить можно ли внести изменения в типовую конфигурацию таким образом чтобы при сравнении не отображались данные изменения?Или говоря другим языком можно ли создать измененную конфигурацию таким образом чтобы она считалась "типовой"?

Вообще возможно, сам конечно такого не делал, но исходя из опыта создания собственных конфигураций смею предположить что: 1) Взять конфигурацию поставщика и доработать ее. 2) Сделать из нее конфигурацию поставки. 3) Обновить рабочую конфигурацию из своей доработанной конфигурации поставки.
В таком случае при сравнении вашей конфигурации с конфигурацией поставщика, никаких изменений видно не будет.

И если такая возможность есть то как это можно определить?

Скачать текущий релиз(тот с которым вы работаете) с сайта 1С или дисков ИТС, развернуть и сравить свою конфигурацию уже с ней. Тогда 100% можно понять, доработана или нет конфигурация.

x[2].ToString().Length

?

В форме делаешь:

ПодключитьОбработчикОжидания(<ИмяПроцедуры>, <Интервал>, <Однократно>)

в синтаксис-помощнике более подробно описано про этот метод.

В первом варианте, вы в запросе подставляете просто число(для отбора из регистра) и это конечно же вам ничего не вернет, так как программа не понимает по какому счету вам нужно вернуть данные(должна быть передана ссылка или массив ссылок). А во втором случае вы уже передаете ссылку, поэтому и данные возвращает.

Перед while добавить
NewZombie = Zombie()
И далее по коду заменить Zombie на NewZombie?