Проблема в том, что элемента уже нет на странице. Он есть в памяти драйвера, но в DOM уже нет
Поэтому, когда драйвер получает коману обратиться к элементу, для него все ок пока он не начинает искать его в браузере.
Вторым похожим сценарием может быть пересоздание элемента. Если вдруг элемент был почему-то пересоздан на странице, у него уже другой идентификатор, и драйвер о нем не знает
Я не видел вашего кода, но, подозреваю, вы записываете элемент в переменную, а потом к ней обращаетесь. Что, собственно, с точки зрения программирования, правильно
Выход простой: не сохраняйте в переменную. Ищите элемент каждый раз заново и сразу же выполняйте нужное дейсвие.
browser.find_element_by_id("your_element_id").click()