Итак… я затупил… надо было ткнуть на значек громкости в трее зайти в sound preference => sound effects => alert volume выставить = ))) все, в скайпе все заработало. А вот в qutim(аське) нет… звук когда отправляешь сообщение проигрывается, а при входящем — тишина…
