Вытаскиваем из localStorage данные. это будет строка. превращаем в JSON, проходим циклом. Если попался нужный для удаления id - переходим к следующему шагу. Если нет - добавляем в новый массив. после цикла записываем в localStorage новый массив newdata.
let data = '[{"name": "Купить хлеб", "done": false},{"name": "Купить молоко", "done": true},{"name": "ss", "done": false, "id": 64},{"name": "sss", "done": false, "id": 91},{"name": "aaaaa", "done": false, "id": 77}]';
let jsondata = JSON.parse(a);
let newdata = [];
for(let x of jsondata){
if(x.id == 91){
continue;
}
newdata.push(x);
}