DevMan

система автоматического создания виртуальных машин с нужными параметрами (ось/ее конкретная версия, набор необходимого ПО).
связи с виртулбоксом как таковой нет, хотя вагрант может использовать и его для создания виртуальных машин.

вагрант:
образ не нужно качать постоянно, он скачивается один раз и лежит себе на диске. периодически его только обновлять.
весь нужный стэк можно поднимать автоматом при билде вмки. если комп не слоупок и нормальный инет, это занимает 5-10 минут.
при желании собираешь свой образ с уже установленным стеком и подсовываешь его при билде вмки.

докер:
проще вагранта по ресурсам. но гораздо менингитнее в плане изучения/поддержки.

в целом все зависит от задач. на многих задачах, особенно уровня "одностраничный лендос" или "бложик на вп" можно вполне спокойно и успешно обходиться без них.

1. отдельные образы. ибо может потребоваться другая версия софта, другие настройки и все такое.
2. https://www.jetbrains.com/help/phpstorm/configurin...
3. проект живет на маке, в вагрант он автоматически монтируется. по этой причине гит и некоторые другие инструменты удобнее иметь на хосте. хотя при желании конечно же можно держать все в виртуалке, но это менее удобно.
4. смотреть п. 3
5. делают. но я в таком не вижу никакого смысла.

даете права юзеру мускуля которым подключаетесь на удаленные конекты.
ну и, соответственно, конектитесь по ip хоста.

тут пример https://laracasts.com/discuss/channels/servers/con...