Кирилл Кудрявцев

Проблема в том что вы не раздаете статику, подумайте как будет загружаться js/css если с сервера не загрузить их.

Необходимо указать адрес виртуальной машины на которой запущена бд.

Можно использовать PM2, но там только половина необходимых для вас параметров.
Также в процессе разработки можно использовать отладчик от Google Chrome.

Как один из вариантов использовать Docker для сборки, в нем можно будет скомпилировать с нужными пакетами и версией gcc.

Лучше использовать nginx в роли proxy pass.
Достаточно не плохая статья

Пример, измени под себя.

...
const exec = require('child_process').exec;
...
const paths = {
    allSrcJs: 'src/**/*.js',
    libDir: 'lib',
};
gulp.task('main', gulp.series('build', (callback) => {
    exec(`node ${paths.libDir}`, (error, stdout) => {
        console.log(stdout);
        return callback(error);
    });
}));

gulp.task('watch', () => {
    gulp.watch(paths.allSrcJs, ['main']);
});

С помощью метода messages.getHistory можно получить список сообщений в чате/диалоге, а если указать count=1 можно получить последнее сообщение.
VK Docs

Будет достаточно использовать MongoDb с кешированием в памяти, так как 1.5кк записей (по 200 байт) будет занимать не более 0.4 гб.

Любая ORM библиотека с поддержкой SQLite.

Как из вариантов, например можно сохранить in-Memory бд ip пользователя с которого пришел запрос, так как нужно будет проверять каждое соединение.
Так как вы пишите на express'e то скорее всего вы будете/используете NGINX, то эффиктивнее можно будет использовать соебразный blacklist в нём.

# /usr/local/nginx/conf/some.conf
include blacklist.conf;

# /usr/local/nginx/conf/blacklist.conf
location / {
  # ip's
  deny    8.8.8.8;
}

Есть Electron-builder для сборки проекта в один exe (ну или что вам там нужно). А для для обработки FS системы нужно настраивать build'ер (сейчас точно не знаю).