Для начала нужно посмотреть на каком протоколе эта Кобра работает. Возможно в основе там стоит TCP ну а вообще на прикладном уровне поверх может быть что угодно. Corba/RMI/Soap e.t.c. Надо разбирать PHP приложение и смотреть через какие библиотеки или стандарты-протоколы происходит взаимодействие с Коброй.
В рамках этого вопросника больше нечего сказать. Тут даже недостаточно одного ответа. Тут - как-бы экспертная система получается. Много вопросов и ответов.