Возможно порт 25 заблокирован.
Попробуйте использовать 587 для SMTP, его же сначала и проверьте telnet-ом.

Я использую Virtualmin.
Немного донастроил - подключил nginx в качестве фронт-энда для apache.
Остальное Virtualmin сам делает.

Но он не решает проблему с установкой разных версий PHP.

Если вы используете сервер от Masterhost или другого провайдера, то вам надо у них подтвердить.
Но если вы используете свой сервер - по умолчанию нет никаких ограничений на время исполнения процесса.