Нативный select плохо стилизуется, насколько знаю. К тому же на iOS как всегда есть свои особенности.
Разные варианты.
1. Попробуйте накинуть для iOS -webkit-appearance: none;
2. Оставьте для iOS дефолтное отображение, т.е. не применяйте весь ваш css.
3. Используйте кастомный select (например Choices.js).