Банально прав не хватает. Линух - это НЕвинда, сколь бы виндоподобный дистриб не брать. Линух - это UNIX (ну или почти UNIX-для копирайт-наци), и в нем принципиально иной подход к безопасности. Частично такой подход действует на Windows Server, ну похожий немного. Вне домашнего каталога пользователя - прав нет нигде и ни на что. Ну еще в /tmp есть. А уж переименовать файл, принадлежащий или юзеру www или руту - ну тут сразу барабан через плечо.
webirus правильно сказал - только ssh, только хардкор :-)