Есть. Называется "мой любимый поисковый сервер" :)
Потому что, как таковой "системы линукс" нет. Есть дистриб А, дистриб В, дистриб С, основанные на ядре Linux и некотором наборе утилит для управления ядром и пользовательскими программами, а также некоторыми (различными от дистриба к дистрибу) системами инициализации задач и пакетным менеджером, назначение которого - установка программ. Есть дистрибы совсем без последнего, в таких программы собирают из исходных текстов, для новичка они существенно сложнее, хотя, конечно же, если такую систему одолеть - то на пакетные уже начинаешь смотреть свысока. Хотя у них просто другое назначение.
Поскольку нет никакой централизации, то нет и централизованной документации, в отличие скажем от FreeBSD, где все сосредоточено в одном центре - и это одновременно и хорошо и плохо.
Поэтому найти единый учебник, в котором бы одновременно рассматривались bash, X.org, системы инициализации (initd/systemd), DE (какой? их десятки) - невозможно, его попросту никто писать не будет.
