может это Apache'вский Options Multiviews?

вот я переписал на Native JS код данный выше, и теперь можно добавить эту в закладки этот адрес:

javascript:var g=[];for(var i in document.all) if(document.all.hasOwnProperty(i) && document.all[i].id) g.push('#'+document.all[i].id); alert(g.join("\n"));

и нажимать на любой странице, чтобы увидеть список всех id на странице.

Страницы во FLASH не являются HTML страницами в принципе.
При навигации внутри флеша адрес страницы не меняется — аналитика их и не показывает.
Даже поисковики эти страницы не видят, да и всё содержимое флешки не индексирует.

Вообще, не понимаю почему вам тот, кто разрабатывал сайт, не рассказал об этом.

Может быть можно выкрутиться через якорь страницы. Но о поддержке hashchange event у Google Analytics мне не известно. (А быстро нагуглить не выходит))