Bodik

1. Сбор требований
1.1 Написание функционального задания
2. Проектирование
2.1 Интерфейса
2.2 Архитектуры
3. Планирование
3.1 Декомпозиция проекта на задачи
3.2 Определение необходимых ресурсов
3.3 Составление графика реализации
4. Согласование
5. Документирование
5.1 Написание технического задания
6. Старт разработки
6.1 Разграничение ролей и обязанностей
6.2 Разработка по плану
6.3 Показ демоверсии 1
6.4 Корректирование плана и требований после демоверсии 1
6.5 Разработка по плану 2
6.6 Показ демоверсии 2
6.7 Утверждение версии, заказ дизайна или выход на еще одну демоверсию и возврат к пункту 6.7
6.8 Тестирование версии, стабилизация и релиз бета версии
6.9 Верстка дизайна и внедрение верстки в проект
7. Финализация оставшегося функционала
8. Нагрузочное тестирование, тестирование безопасности
9. Рефакторинг
10. Пред релизная демонстрация и утверждение на деплой
11. Документирование кода и проекта
11.1 Комментирование кода
11.2 Составление хелпа по развертке проекта, настройке конфигов, включении\отключении фич не выведенных в CMS
12. Деплой
12.1 Установка на релиз сервер
12.2 Нагрузочное тестирование
12.3 Настройка бекапов и контроля версий для апдейтов
13. Сапорт

Советую Microsoft Natural Ergonomic Keyboard 4000 :)
К концу дня, даже если весь день писать код, запястья не устают.

1. Шлите пользователям уведомляки о MyIsam
2. Повесте тригер\mysql-proxy который будет ревратить myisam в innodb
3. Для фултекста еще сфинкс к mysql прикрутите
4. И это все можно рекламировать как бонусы, а не ограничения

Всё есть, есть надстройка над нагиосом, называется Centreon www.centreon.com/

Использую более года, посмотрите возможно этот вариант как раз Вам и нужен.